Generated by All in One SEO v5.0.0.1, this is an llms.txt file, used by LLMs to index the site. # NEOMATRIX A H2020 funded project on the Neolithic past of the Mediterranean ## Sitemaps - [XML Sitemap](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/sitemap.xml): Contains all public & indexable URLs for this website. ## Posts - [News, events and recent publications](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/whats-new/) - [“Ancient sheep genomes reveal four millennia of North European short-tailed sheep in the Baltic Sea region” published in Genome Biology and Evolution](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/05/26/ancient-sheep-genomes-reveal-four-millennia-of-north-european-short-tailed-sheep-in-the-baltic-sea-region-published-in-genome-biology-and-evolution/) - The research is published by a team of researchers which includes members of the NEOMATRIX network: Martin N. A. Larsson, Pedro Morell Miranda, Li Pan, Kıvılcım Başak Vural, Damla Kaptan, André Elias Rodrigues Soares, Hanna Kivikero, Juha Kantanen, Mehmet Somel, Füsun Özer, Anna M. Johansson, Jan Storå, and Torsten Günther. - ["Hidden in the bones" video awarded by METU](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/06/09/hidden-in-the-bones-video-awarded-by-metu/) - METU MSc students and NEOMATRIX team members Merve Nur Güler and Gözde Atağ impressed the judges in the “Share UR Research Video Competition II” organized by METU SCT and GİSAM with their captivating video titled “Hidden in the Bones“, where they showcased their scientific research on ancient DNA. Now you may watch the video on - [EkoEvo online discussion on 2022 Nobel Prize and ancient DNA](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/10/25/ekoevo-online-discussion-on-adna-and-2022-nobel-prize/) - Ecology and Evolutionary Evolution Association (EkoEvo) in Turkey organized an online activity to discuss the awarding of the 2022 Nobel Prize in Physiology or Medicine to Svante Pääbo for his work on ancient DNA and human evolution. Broadcasted over YouTube, this discussion was an opportunity of outreach to inform the general public in Turkey about - [Ancient DNA discussed on Turkish popular science channel](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/10/05/ancient-dna-discussed-on-turkish-popular-science-channel/) - YouTube popular science channel Gelecek Bilimde (The Future is in Science) invited Ezgi Altınışık from METU-Hacettepe team of the NEOMATRIX network to acquaint the audience with the topic of ancient DNA analysis, upon the awarding of the Nobel 2022 Prize in Physiology or Medicine to Svante Pääbo. You may watch the video on YouTube with - [Video from NEOMATRIX seminars to undergraduate students](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/07/01/video-from-neomatrix-seminars-to-undergraduate-students/) - On 11 June 2022 in METU, Ankara, we had a fascinating row of bioarchaeology seminars from the NEOMATRIX PIs, especially directed at undergraduate biology students and open to general public. Anders Götherström talked on Vikings, Eva-Maria Geigl on the domestication of cats, Argyro Nafplioti on the bioarchaeological uses of isotopes and Thierry Grange on the - [Human inbreeding and societal change discussed on soL TV](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/07/08/inbreeding-and-societal-change-discussed-on-sol-tv/) - Another episode of the series titled "Bilim ve Aydınlanma" (Science and Enlightenment) of soL TV YouTube channel was dedicated to the latest article of Kanat Gürün from METU-Hacettepe team of the NEOMATRIX network. Gürün expounded on how the frequency of human inbreeding has changed historically, how the accumulation of private property affected consanguineous marriages, and if - [Kinship in ancient societies of Anatolia featured on YouTube](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/04/29/kinship-in-ancient-societies-of-anatolia-featured-on-youtube/) - The latest episode of "Bilim ve Aydınlanma" (Science and Enlightenment) on soL TV YouTube channel hosted Mehmet Somel, co-PI of METU-Hacettepe team for the NEOMATRIX project. Somel talked about the latest study published by the METU-Hacettepe anient DNA team, which investigates the social relations of people who lived in Anatolia around ten thousand years ago. - [Million-year-old DNA featured on soL TV YouTube channel](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/04/01/million-year-old-dna-featured-on-youtube-channel-for-the-turkish-public/) - An episode of the series "Bilim ve Aydınlanma" (Science and Enlightenment) of soL TV YouTube channel covered the research conducted by scientists from the NEOMATRIX network. The topic was the exciting recovery of genome-wide data from ancient mammoth specimens, two of which are more than one million years old. Ekin Sağlıcan, a researcher from METU-Hacettepe - [Science Academy YouTube channel hosts Mehmet Somel](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/03/31/science-academy-youtube-channel-hosts-mehmet-somel/) - Meraklısına Bilim (Science for the Curious), a YouTube series produced by the Science Academy and Medyascope TV hosted Mehmet Somel, co-PI of METU-Hacettepe team for the NEOMATRIX project. Somel explained how ancient DNA research gives us new insights, and gave information about METU/Hacettepe aDNA lab projects investigating the Neolithic transformation. You may watch the video - [Laboratory Technician position at Hacettepe University HUMAN-G and METU Ancient DNA Laboratories](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/12/05/laboratory-technician-position-at-hacettepe-university-human-g-and-metu-ancient-dna-laboratories/) - JOB DESCRIPTION: – Organization and implementation of experiments in our laboratories. – Tracking and procurement of chemical stocks. – Preparation of chemicals -Tracking and procurement of consumables. – General administration of the laboratory, including equipment acquisition for infrastructure development. – Training of new and prospective graduate students in basic laboratory usage and protocols used within - [NEOMATRIX partners come together in Ankara!](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/06/25/partners-met-in-ankara/) - As we hit the 18th month of our project, PIs and ESRs from all NEOMATRIX partners finally came together physically in Ankara to evaluate our activities up to now and plan the future of our scientific collaboration. We started the program with an excursion to Aşıklı Höyük, where we were hosted by site directors Mihriban - [Recordings of the NEOMATRIX final meeting](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2025/02/10/recordings-of-the-neomatrix-final-meeting/) - The NEOMATRIX Final meeting was held on 5-6 December 2024 by FORTH in Heraklion. The event was organized by Dr. Argyro Naflioti (FORTH) in the form of a hybrid two-day event, which included sessions with the objective to share the project’s scientific results among partners. You can now view the recordings of this seminar in - [Recordings of the symposium "The Neolithic expansion from Anatolia to northern France"](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2025/02/05/recordings-of-the-symposium-the-neolithic-expansion-from-anatolia-to-northern-france/) - "The Neolithic expansion from Anatolia to northern France" symposium was held last November by CNRS as part of our dissemination activities. You can now view the recordings of this seminar in two parts! Part 1 includes:E.-M. Geigl (IJM): BienvenueM. Somel (METU): Welcome addressC. Atakuman (METU): The archaeological perspective of the Neolithic revolution in the Middle - [NEOMATRIX final meeting held in Heraklion](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/12/10/neomatrix-final-meeting-held-in-heraklion/) - After four years of dedicated effort, we have successfully completed NEOMATRIX! Our final meeting was held in Heraklion from the 5th to the 7th of December. The three-day event was hosted by FORTH, and organized by Dr Argyro Nafplioti. As part of the event, a symposium was held in Auditorium Georgios Lianis, with the below - [Symposium was held in Paris -exhibition open till December 16](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/11/22/symposium-was-held-in-paris-exhibition-open-till-december-16/) - A one-day international symposium organized by the CNRS team presented to students and the general public both individual and collaborative achievements of the Turkish and French partners of the NEOMATRIX project: the Neolithic expansion from the archaeogenetic perspective. The symposium featured talks by Çiğdem Atakuman, Füsun Özer, Jean-Paul Demoule, Oğuzhan Parasayan, N. Ezgi Altınışık, Mehmet - ["The population history of domestic sheep revealed by paleogenomes" published in Molecular Biology and Evolution](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/10/23/3793/) - The latest paper by our researchers delves into the history of sheep, one of the first domesticated animals in Neolithic West Eurasia. The zooarchaeological record suggests that domestication first took place in Southwest Asia, although much remains unresolved about the precise location(s) and timing(s) of earliest domestication, or the post-domestication history of sheep. In this - [Symposium & exhibition in Université Paris-Cité: The Neolithic expansion from Anatolia to France](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/10/11/symposium-exhibition-in-universite-paris-cite-the-neolithic-expansion-from-anatolia-to-france/) - A one-day international symposium will present to the general public on November 19, 2024 at Buffon Amphitheater of the Université Paris-Cité, both individual and collaborative achievements of the Turkish and French partners of the international project NEOMATRIX that studied the Neolithic expansion from the archaeogenetic perspective. This symposium will accompany an exhibition conceived and organized - ["The first complete genome of the extinct European wild ass (Equus hemionus hydruntinus)" published in Molecular Ecology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/07/02/the-first-complete-genome-of-the-extinct-european-wild-ass-equus-hemionus-hydruntinus-p/) - Our researchers present palaeogenomes of three morphologically unidentified Anatolian equids dating to the first millennium BCE, sequenced to a coverage of 0.6–6.4×. Mitochondrial DNA haplotypes of the Anatolian individuals clustered with those of Equus hydruntinus (or Equus hemionus hydruntinus), the extinct European wild ass, secular name ‘hydruntine’. Further, the Anatolian wild ass whole genome profiles fell outside - ["Late Neolithic collective burial reveals admixture dynamics during the third millennium BCE and the shaping of the European genome" published in Science Advances](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/06/22/late-neolithic-collective-burial-reveals-admixture-dynamics-during-the-third-millennium-bce-and-the-shaping-of-the-european-genome/) - The third millennium BCE was a pivotal period of profound cultural and genomic transformations in Europe associated with migrations from the Pontic-Caspian steppe, which shaped the ancestry patterns in the present-day European genome. A team of researchers including members of the NEOMATRIX network performed a high-resolution whole-genome analysis including haplotype phasing of seven individuals of - ["Population genomic history of the endangered Anatolian and Cyprian mouflons in relation to worldwide wild, feral, and domestic sheep lineages" published in Genome Biology and Evolution](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/04/29/comparison-and-optimization-of-protocols-and-whole-genome-capture-conditions-for-ancient-dna-samples-p/) - Once widespread in their homelands, the Anatolian mouflon (Ovis gmelini anatolica) and the Cyprian mouflon (Ovis gmelini ophion) were driven to near extinction during the 20th century and are currently listed as endangered populations by the International Union for Conservation of Nature. While the exact origins of these lineages remain unclear, they have been suggested - ["Comparison and optimization of protocols and whole-genome capture conditions for ancient DNA samples" published in BioTechniques](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/03/27/comparison-and-optimization-of-protocols-and-whole-genome-capture-conditions-for-ancient-dna-samples-published-in-biotechniques/) - Scientists from the NEOMATRIX network published their article titled "Comparison and optimization of protocols and whole-genome capture conditions for ancient DNA samples" in BioTechniques. Ancient DNA (aDNA) obtained from human remains is typically fragmented and present in relatively low amounts. In this study our researchers investigate a set of optimal methods for producing aDNA data - [New joint lab meeting](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/05/24/new-joint-lab-meeting/) - We had another joint lab meeting this week, where Nora Bergfeldt (SU CPG) presented "Genetic traces of cholera in Mexican remains",Eva-Maria Geigl & Thierry Grange (IJM/CNRS) presented "DNA in an 1846 usurper's flute discloses his claims", and Mehmet Somel (METU/Hacettepe) presented "Untangling genetic admixture and material culture patterns during the Neolithization of the Aegean". - [Joint lab meeting featuring forensics presentation](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/02/01/3698/) - Yesterday we had a joint lab meeting with three inspiring presentations: "Forensics and ancient DNA" by Adam Staatig (SU/CPG), "Genomic insights into Roman Anatolia" by N. Ezgi Altınışık (METU/Hacettepe), and "Issues in ancient mitogenome analysis" by Thierry Grange (IJM/CNRS). - [We had another joint lab meeting](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/03/22/we-had-another-joint-lab-meeting/) - In our latest joint lab meeting, we had three presentations: "Archaeogenetic analysis of Neolithic sheep from Anatolia" by Damla Kaptan from METU/Hacettepe, "Identification of the 18 World War II executed citizens of Adele, Rethymnon, Crete using an ancient DNA approach and low coverage genomes" by Nikos Psonis from FORTH-IMBB and "An explanation for the neighbour - ["Antik DNA örnekleri için protokollerin ve tüm genom yakalama koşullarının karşılaştırılması ve optimizasyonu" BioTechniques'te yayımlandı](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2024/03/27/comparison-and-optimization-of-protocols-and-whole-genome-capture-conditions-for-ancient-dna-samples-published-in-biotechniques/) - NEOMATRIX ağından bilim insanları "Antik DNA örnekleri için protokollerin ve tüm genom yakalama koşullarının karşılaştırılması ve optimizasyonu" başlıklı makalelerini BioTechniques'te yayımladı. Makale Reyhan Yaka, Maja Krzewińska, Vendela Kempe Lagerholm, Anna Linderholm, Füsun Özer, Mehmet Somel ve Anders Götherström tarafından kaleme alındı. https://www.future-science.com/doi/10.2144/btn-2023-0107 - [Antik DNA laboratuvar teknisyeni ilanı](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/12/05/laboratory-technician-position-at-hacettepe-university-human-g-and-metu-ancient-dna-laboratories/) - Hacettepe Üniversitesi HUMAN-G ve ODTÜ Antik DNA laboratuvarlarında teknisyen olarak çalışacak biyolog ve/veya moleküler biyolog alınacaktır. İşe alınacak eleman aktif bir bilimsel araştırma grubunun üyesi olarak çalışacaktır. İş Tanımı: - Laboratuvarlarımızda; • deneylerin organizasyonu ve uygulanması, • kimyasal stoklarının takibi ve temini, • kimyasalların hazırlanması, • sarf malzeme takibi ve temini, • altyapı geliştirilmesi için - ["Genome sequences of 36,000- to 37,000-year-old modern humans at Buran-Kaya III in Crimea" was published in Nature Ecology & Evolution](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/10/24/genome-sequences-of-36000-to-37000-year-old-modern-humans-at-buran-kaya-iii-in-crimea-was-published-in-nature-ecology-evolution/) - Researchers from Institut Jacques Monod, including our esteemed colleagues within the NEOMATRIX network, analyzed new genomes together with published ones in their latest study. It allowed them to update the model of population movements, interactions, and turnovers during the peopling of Europe in the Early Upper Paleolithic. The study revealed genetic links between early individuals - ["aMeta: an accurate and memory-efficient ancient metagenomic profiling workflow" published in Genome Biology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/10/24/ameta-an-accurate-and-memory-efficient-ancient-metagenomic-profiling-workflow-published-in-genome-biology/) - A team of researchers which includes members of the NEOMATRIX network developed a fully automated ancient metagenomics pipeline. This promising method will address some important challenges in the area of ancient metagenomics, such as a relatively high false-positive discovery rate, where exotic microbes, animals, plants, fish etc. can often be found where they are not - [EAA 2023'te "Akdeniz'in Neolitikleşmesi" oturumu düzenledik!](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/09/01/eaa-symposium/) - NEOMATRIX paydaşları olarak Avrupa Arkeologlar Derneği'nin bu yıl 30 Ağustos - 2 Eylül 2023 tarihlerinde Belfast'ta toplanan olağan buluşmasında (EAA 2023) bir oturum düzenledik. Our session entitled “Akdeniz'in Neolitikleşmesi: Kadim meselelere bütüncül yaklaşımlar" başlığını taşıyan oturumumuzda arkeoloji, biyoarkeoloji, arkeogenetik, biyojeokimya, arkeo-tarihleme ve dilbilim gibi çeşitli disiplinlerden toplam on bildiri sunuldu ve Prof. Yılmaz Selim Erdal, Dr. - [EAA 2023 featured a "Neolithization of the Mediterranean" session organized by the NEOMATRIX team!](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/09/01/eaa-symposium/) - Members of the NEOMATRIX team organized a session at this year's meeting of the European Association of Archaeologists (EAA 2023) which was held at Belfast in Ireland on 30 August - 2 September 2023. Our session entitled “Neolithization of the Mediterranean: Integrated Approaches to Old Questions” included a total of ten paper presentations on this topic covering - [Call for EAA 2023 session "Neolithization of the Mediterranean: Integrated Approaches to Old Questions"](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/01/09/call-for-eaa-2023-session-neolithization-of-the-mediterranean-integrated-approaches-to-old-questions-2/) - As the NEOMATRIX team and through our collaboration with our colleague Tristan Carter from McMaster University, we will be hosting a session in the annual meeting of the European Association of Archaeologists this year (EAA 2023). The deadline for proposals is February 9th 2023, 23:59 CET, and the applications must be submitted through the EAA - [EAA 2023 kapsamında düzenleyeceğimiz “Akdeniz'in Neolitikleşmesi" konulu sempozyum için bildirilerinizi bekliyoruz!](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/01/09/call-for-eaa-2023-session-neolithization-of-the-mediterranean-integrated-approaches-to-old-questions-2/) - NEOMATRIX ekibi olarak ve McMaster Üniversitesi'nden meslektaşımız Tristan Carter işbirliğiyle, Avrupa Arkeologlar Derneği'nin bu yılki olağan buluşmasında (EAA 2023) bir oturuma evsahipliği yapacağız. Bildiri başvuruları için son tarih 9 Şubat 2023 günü saat 23:59 CET olup, başvuruların EAA web sitesi üzerinden yapıkması gerekmektedir. Toplantı Kuzey İrlnda'nın Belfast şehrinde 30 Ağustos - 2 Eylül 2023 tarihlerinde gerçekleşecektir. - [FORTH-ICS araştırmacıları son çalışmalarını anlattı](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/05/10/joint-lab-meeting-led-by-forth-researchers/) - Son ortak lab toplantımızı 9 Mayıs'ta gerçekleştirdik. FORTH Bilgisayar Bilimleri Enstitüsü'nden (ICS) Pavlos Pavlidis ve Maria Evangelinou “Çeşitli senaryolar altında qpAdm'in değerlendirilmesi" ve Stefanos Papadantonakis “Cinsiyete dayalı göç çıkarımlaması" başlıklı sunumlar yaptılar. Her iki sunumu da heyecan verici tartışmalar takip etti. - [ODTÜ/Hacettepe ve SU araştırmacıları son çalışmalarını sundu](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/05/31/joint-lab-meeting-with-metu-hacettepe-and-su-talks/) - Proje paydaşları olarak 30 Mayıs günü bir ortak lab toplantısı düzenledik. Üç sunum yapıldı. ODTÜ'den Gözde Atağ “Anadolu ve Kıbrıs'taki soyu tükenme tehlikesi altındaki yaban koyunlarına dair genetik kavrayışlar", Hacettepe Üniversitesi'nden Hande Çubukçu "Batı Avrasya'nın antik genomlarına ilişkin genotip impütasyonunun bir değerlendirmesi" ve Stockholm Üniversitesi'nden Anders Götherström "Mary Rose gemicileri" başlıklı birer sunum yaptılar. Verimli geçen - [SMBE 2023 kapsamında başarılı bir sempozyum düzenledik!](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/07/28/our-symposium-in-smbe-2023-was-a-success/) - NEOMATRIX paydaşları olarak (Eva-Maria Geigl, Anders Götherström, Pavlos Pavlidis ve Mehmet Somel) geçtiğimiz hafta İtalya'nın Ferrara şehrinde düzenlenen Moleküler Biyoloji ve Evrim Derneği (SMBE) 2023 toplantısında bir sempozyum düzenledik. Sempozyumda birbirinden ilgi çekici beş sunum yapıldı: Victoria Mullin ve Torsten Günther Avrupa'da yaban öküzünden sığıra cinsiyete dayalı melezlenmeyi ele aldılar. Elisabetta Canteri evcilleştirilen bitki ve hayvan türlerinin yayılımını soy, mobilite ve iklimi kullanarak - [Our symposium in SMBE 2023 was a success!](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/07/28/our-symposium-in-smbe-2023-was-a-success/) - As NEOMATRIX partners (Eva-Maria Geigl, Anders Götherström, Pavlos Pavlidis and Mehmet Somel) we organized a symposium at the Society for Molecular Biology and Evolution 2023 meeting in Ferrara last week. We had five great talks: Victoria Mullin and Torsten Günther told us about sex-biased admixture from aurochs into cattle in Europe. Elisabetta Canteri described a new modeling approach to explain the spread of plant and - [“Holosende Güney Doğu Asya ve Doğu Akdeniz'de insan hareketliliğinin uzamsal ve zamansal heterojenlik örüntüleri” Science Advances’te](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/12/08/spatial-and-temporal-heterogeneity-in-human-mobility-patterns-in-holocene-southwest-asia-and-the-east-mediterranean-published-in-current-biology/) - Araştırmacılarımız son çalışmalarında Anadolu, Yunanistan, Gürcistan, Azerbaycan ve İran'dan ~MÖ 7,350 ile MS 200 arasına tarihlenen 35 antik genom ürettiler. Düzenli insan hareketliliği sonucu bölgedeki genetik çeşitliliğin Holosen boyunca giderek arttığını, fakat mobilite örüntülerinin zaman içinde değiştiğini gördüler. Holosenin ilk yarısında hareketliliğin daha fazlası Güney Doğu Asya ve Doğu Akdeniz içerisinde gerçekleşirken, son 6 bin - [Joint lab meeting led by FORTH-ICS](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/05/10/joint-lab-meeting-led-by-forth-researchers/) - We held a joint lab meeting on the 9th of May, which comprised two talks by FORTH Institute of Computer Science (ICS) researchers. Pavlos Pavlidis and Maria Evangelinou gave a presentation titled "Evaluating qpAdm under various scenarios", and Stefanos Papadantonakis' talk was about "Sex-biased migration inference". Both presentations sparked exciting discussions. - [Joint lab meeting with METU/Hacettepe and SU talks](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2023/05/31/joint-lab-meeting-with-metu-hacettepe-and-su-talks/) - Our latest joint lab meeting was held on the 30th of May. We had three talks. First by Gözde Atağ from METU on "Genomic insights into the endangered mouflon populations of Anatolia and Cyprus", then by Hande Çubukçu (Hacettepe University) on "An evaluation of genotype imputation on ancient genomes from West Eurasia", and finally by Anders - [Ortak makale tartışması](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/10/19/joint-paper-discussion/) - Son dönemde yayımlanan ve çalışma konumuzla bağlantısı olan iki önemli makaleyi tartışmak için 19 Ekim'de çevrimiçi olarak bir araya geldik: Marchi et al., 2022 ve Lazaridis et al., 2022 makaleleri üzerine sırayla ODTÜ/Hacettepe'den Dilek Koptekin ve FORTH-ICS'den Stefanos Papadantonakis birer sunum yaptılar ve tartışmaya öncülük ettiler. NEOMATRIX laboratuvarlar arası değişim ziyaretleri kapsamında Ankara'ya henüz birkaç gün önce - [Joint paper discussion](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/10/19/joint-paper-discussion/) - On October 19th, we met virtually for a joint discussion on two recent papers: Marchi et al., 2022 and Lazaridis et al., 2022. The discussions were led respectively by Dilek Koptekin from METU/Hacettepe, and Stefanos Papadantonakis from FORTH-ICS. Stefanos just arrived in Ankara as part of the cross-lab visits, he will be here until the end of November. - [“Yukarı Mezopotamyanın Neolitik dönüşüm sırasındaki demografik ve kültürel dinamizmine dair genomik bir enstantane" Science Advances'te](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/11/04/a-genomic-snapshot-of-demographic-and-cultural-dynamism-in-upper-mesopotamia-during-the-neolithic-transition-published-in-science-advances/) - Araştırmacılarımızın son makalesinde, Anadolu'daki en önemli çanak çömleksiz Neolitik yerleşimlerden biri olan Çayönü Höyük'ten elde edilen antik DNA bilgisi, Yukarı Mezopotamya'nın Neolitik dönüşüm sürecindeki kültürel dinamizminin sadece verimli topraklarıyla değil, aynı zamanda bölgelerarası demografik ilişkilerle bağlantılı olduğunu gösteriyor. Makalenin yazarları N. Ezgi Altınışık, Duygu Deniz Kazancı, Ayça Aydoğan, Hasan Can Gemici, Ömür Dilek Erdal, Savaş - ["Spatial and temporal heterogeneity in human mobility patterns in Holocene Southwest Asia and the East Mediterranean" published in Current Biology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/12/08/spatial-and-temporal-heterogeneity-in-human-mobility-patterns-in-holocene-southwest-asia-and-the-east-mediterranean-published-in-current-biology/) - In their latest study, our researchers produced 35 ancient genomes from Anatolia, Greece, Georgia, Azerbaijan and Iran ranging from ~7,350 BCE to 200 CE. They found that genetic diversity in the region steadily increased during the Holocene, which can be explained by continuous human mobility. However, the mobility patterns were not the same over time. - [ESEB 2022 Prag'da evcilleştirme üzerine ortak NEOMATRIX sempozyumu](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/08/19/joint-symposium-in-eseb-pregue/) - Stockholm Üniversitesi, IJM-CNRS ve ODTÜ-Hacettepe ekipleri olarak Prag'daki ESEB 2022'de Anders Götherström, Eva-Maria Geigl, Thierry Grange, Füsun Özer, Gözde Atağ, Mehmet Somel ve Mustafa Özkan'ın katılımlarıyla evcilleştirme konusunda antik DNA'nın kullanımı üzerine bir sempozyum düzenledik. Açılış konuşmasını Laurent Franz'ın yaptığı oturumda domateslerden köpeklere çeşitli konularda heyecan verici katkılar yapıldı. Oturumda Füsun Özer, Anadolu'daki Neolitik koyunlar - [Joint symposium on domestication in ESEB, Prague](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/08/19/joint-symposium-in-eseb-pregue/) - As Stockholm University, IJM-CNRS and METU-Hacettepe, we organized a joint symposium in ESEB 2022 in Prague on studying domestication via ancient DNA, with the participations of Anders Götherström, Eva-Maria Geigl, Thierry Grange, Füsun Özer, Gözde Atağ, Mehmet Somel and Mustafa Özkan. We had Laurent Franz as keynote speaker, and many exciting contributed talks from tomatoes - [NEOMATRIX paydaşları Ankara'da buluştu!](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/06/25/partners-met-in-ankara/) - Projemizde 18. ayı geride bırakırken, tüm paydaşlardan genç araştırmacılar ve grup liderleri, şimdiye dek olan etkinliklerimizi değerlendirmek ve bilimsel işbirliğimizin geleceğini planlamak için Ankara'da fiziksel olarak bir araya geldi. Programda çevre gezilerine ve açık derslere de yer verdik. İlk günümüzde, Orta Anadolu'nun bilinen en eski köyü olan Aşıklı Höyük'e gittik. Bizi karşılayan Kazı Başkanı Mihriban - [Erzurum'da European Researchers' Night etkinliklerine katıldık](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/09/30/european-researchers-night-in-erzurum/) - Türkiye'de bu yıl European Researchers' Night etkinlikleri Atatürk Üniversitesi'nde "Doğadan Sofraya Bilim" teması çevresinde gerçekleştirildi. NEOMATRIX'in araştırma konusuyla oldukça alakalı olan bu etkinliklere biz de katıldık. Erzurumlu genç araştırmacılar ve araştırmacı adaylarıyla bir araya gelen Mehmet Somel, ilköğretim öğrencilerine antik koyun ve insan kemiklerinden nasıl DNA elde edildiğini anlattı. - [NEOMATRIX takes off amid the COVID-19 pandemic](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/01/01/neomatrix-takes-off-amid-the-covid-19-pandemic-142-words/) - NEOMATRIX is a 3-year project involving research collaboration and exchange of experience across our groups in Ankara, Heraklion, Paris, and Stockholm. The project proposal was designed well before the outbreak of the COVID-19 pandemic, and was officially accepted in May 2020. According to the original proposal, the collaborative team activities would involve travel by researchers - [European Researchers' Night in Erzurum](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/09/30/european-researchers-night-in-erzurum/) - We were in Erzurum Atatürk University for European Researchers' Night activities themed "Science from Nature to your Table" - SCINURTURE. Mehmet Somel introduced children to ancient DNA research on human and sheep bones. - [“A genomic snapshot of demographic and cultural dynamism in Upper Mesopotamia during the Neolithic Transition” published in Science Advances](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/11/04/a-genomic-snapshot-of-demographic-and-cultural-dynamism-in-upper-mesopotamia-during-the-neolithic-transition-published-in-science-advances/) - Ancient DNA from pre-pottery Neolithic people gives new genetic insights into Mesopotamian culture in the latest paper by our researchers. It suggests that Upper Mesopotamia’s cultural dynamism during the Neolithic Transition was the product not only of its fertile lands but also of its interregional demographic connections. The article is authored by N. Ezgi Altınışık, - [Our third joint lab meeting was held](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/03/02/our-third-joint-lab-meeting-was-held/) - We held our third joint lab meeting on the 2nd of March. It was a half-day virtual event comprising four talks, each followed with a Q&A and discussion session. In the first two sessions, Mário Vicente from Stockholm University gave a presentation titled “Ostia Antica: Epidemiological consequences of Roman maritime networks and practices” and Charikleia - [Girit'te hesaplamalı yöntemler çalıştayı](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/12/05/computational-workshop-in-heraklion/) - 29 Kasım - 2 Aralık 2021 tarihlerinde, Girit'in Heraklion (Kandiye) şehrinde NEOMATRIX Projesi kapsamında bir hesaplamalı yöntemler çalıştayı gerçekleştirdik. Dr. Pavlos Pavlidis tarafından yürütülen çalıştaya Yunanistan Araştırma ve Teknoloji Kurumu (FORTH) Bilgisayar Bilimleri Enstitüsü (ICS) evsahipliği yaptı. Bilimsel program, antik numuneler arasındaki akrabalık ilişkilerinin hesaplamalı yöntemlerle araştırılmasına odaklanmıştı. Ayrıca program kapsamında doğa yürüyüşü ve Faistos - [Computational workshop in Crete](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/12/05/computational-workshop-in-heraklion/) - From November 29th to December 2nd 2021, we had a computational workshop in Heraklion, Crete, as part of the NEOMATRIX project. The workshop was led by Dr. Pavlos Pavlidis and hosted by the Foundation for Research and Technology – Hellas (FORTH) Institute of Computer Science (ICS). The scientific program focused on the computational inference of - [Üçüncü ortak lab toplantımızı yaptık](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/03/02/our-third-joint-lab-meeting-was-held/) - Üçüncü ortak lab toplantımızı 2 Mart günü gerçekleştirdik. Yarım gün süren çevrimiçi etkinlikte, her birini soru-cevap ve tartışma oturumlarının takip ettiği dört sunum yapıldı. İlk olarak, Stockholm Ünivesitesi'nden Mário Vicente, "Ostia Antica: Roma İmparatorluğu denizcilik ağı ve faaliyetlerinin salgınlara etkileri" başlıklı bir sunum ve FORTH'dan Charikleia Karageorgiou "Girit yaban keçisi Capra aegagrus cretica'nın kökenlerini ortaya - [Our second joint lab meeting was held](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/10/13/our-second-joint-lab-meeting-was-held/) - We held our second joint lab meeting on the 13th of October. It was a half-day virtual event comprising four talks, each followed with a Q&A and discussion session. METU and Hacettepe University gave a presentation titled “Kinship patterns among ancient genomes shed light on past social traditions of the last 10,000 years”. NEOMATRIX Team - [“En eski insan yapımı melez hayvan olan, Suriye-Mezopotamya kökenli kungaların genetik kimliği” Science Advances'te](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/01/15/the-genetic-identity-of-the-earliest-human-made-hybrid-animals-the-kungas-of-syro-mesopotamia-published-in-science-advances/) - Araştırmacılarımız, insanlar tarafından üretilen ilk melez hayvan olan ve antik Mezopotamya'da savaşlarda kullanılan 4500 yıllık "kunga" adlı hayvanın genetik kimliğini tanımladı. Çalışmanın sonuçları, kungaların güçlü ve hızlı bir evcil eşek ile "hemippe" denilen Suriye yaban eşeğinin melezi olduğunu gösterdi. Makalenin yazarları E. Andrew Bennett, Jill Weber, Wejden Bendhafer, Sophie Champlot, Joris Peters, Glenn M. Schwartz, - [İkinci ortak lab toplantımızı yaptık](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/10/13/our-second-joint-lab-meeting-was-held/) - İkinci ortak lab toplantımızı 13 Ekim günü gerçekleştirdik. Yarım gün süren çevrimiçi etkinlikte, her birini soru-cevap ve tartışma oturumlarının takip ettiği dört sunum yapıldı. İlk olarak, ODTÜ ve Hacettepe Üniversitesi mensubu araştırmacılar "Antik genomlara ilişkin akrabalık örüntüleri son 10 bin yılın geçmiş toplumsal geleneklerine ışık tutuyor" başlıklı çalışmalarını sundu. Laboratuarlar arası fiziksel ziyaretlerin pandemi nedeniyle - [NEOMATRIX'e Girit'teki Neolitik yerleşimlerden yeni sığır ve koyun kemikleri](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/09/20/cattle-and-sheep-bones-were-gathered-from-neolithic-sites-in-greece/) - Yunanistan Araştırma ve Teknoloji Kurumu'ndan (FORTH) Dr. Argyro Nafplioti ve Ege Tarihöncesi Enstitüsü (INSTAP) Doğu Girit Araştırmaları Merkezi'nden Dr. Dimitra Mylona, NEOMATRIX projesi kapsamında analiz edilmek üzere hayvan kemikleri ve dişleri seçtiler. Sığır ve koyun kalıntılarına ait olan kemik ve dişler, Girit'teki iki erken dönem Neolitik yerleşim olan Pelekita Mağarası ile Aposelemis Mezarlığı'ndan bulunmuştu. Örnekler - [Cattle and sheep bones from Neolithic sites in Crete were selected for NEOMATRIX](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/09/20/cattle-and-sheep-bones-were-gathered-from-neolithic-sites-in-greece/) - Dr. Argyro Nafplioti from the Foundation of Research and Technology (FORTH) and Dr. Dimitra Mylona from the Institute for Aegean Prehistory (INSTAP) Study Center for East Crete selected animal bone and tooth samples to analyze as part of NEOMATRIX. The bones and teeth belong to cattle and sheep remains from two early Cretan Neolithic sites, - ["Antik Kuzeydoğu Asya'da insan popülasyon dinamikleri ve Yersinia pestis" Science Advances'te](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/01/06/human-population-dynamics-and-yersinia-pestis-in-ancient-northeast-asia-was-published-in-science-advances/) - Araştırmacılarımızın yeni makalesi Kuzeydoğu Asya'da karmaşık bir demografik tarihe ışık tutarken vebaya neden olan Y. pestis adlı mikroorganizmanın antik izleri hakkında yeni bulgular sunuyor. Makalenin yazarları Gülşah Merve Kılınç, Natalija Kashuba, Dilek Koptekin, Nora Bergfeldt, Handan Melike Dönertaş, Ricardo Rodríguez-Varela, Dmitrij Shergin, Grigorij Ivanov, Dmitrii Kichigin, Kjunnej Pestereva, Denis Volkov, Pavel Mandryka, Artur Kharinskii, Alexey - [“Milyon yıllık DNA mamutların genomik tarihine ışık tutuyor” Nature'da](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/02/17/million-year-old-dna-sheds-light-on-the-genomic-history-of-mammoths-was-published-in-nature/) - Araştırmacılarımızın 2021'deki ikinci makalesi, son Buzul Çağı'nda Kuzey Amerika'yı mesken tutan Kuzey Amerika mamutlarının, tüylü mamut ile şimdiye dek bilinmeyen bir mamut soyunun melezleşmesi sonucu türediğini gösteriyor. Makalenin yazarları Tom van der Valk, Patrícia Pecnerová, David Díez-del-Molino, Anders Bergström, Jonas Oppenheimer, Stefanie Hartmann, Georgios Xenikoudakis, Jessica A. Thomas, Marianne Dehasque, Ekin Sağlıcan, Fatma Rabia Fidan, - [“Antik genomlar Neolitik Anadolu'daki değişken akrabalık örüntülerini ortaya koyuyor” Current Biology'de](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/04/14/new-paper-variable-kinship-patterns-in-neolithic-anatolia-revealed-by-ancient-genomes/) - Araştırmacılarımızın yeni makalesi, Neolitik Anadolu'dan 59 antik genomu kullanarak konut yapılarının tabanına yan yana gömülen bireyler arasındaki genetik akrabalığı sorguluyor. Sonuçlar, Neolitik Anadolu'daki biyolojik olmayan akrabalık örüntülerine işaret ediyor. Makalenin yazarları Reyhan Yaka, Igor Mapelli, Damla Kaptan, Ayça Doğu, Maciej Chyleński, Ömür Dilek Erdal, Dilek Koptekin, Kıvılcım Başak Vural, Alex Bayliss, Camilla Mazzucato, Evrim Fer, - ["İnsanda kendileşme Holosen boyunca azaldı" Current Biology'de](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/07/02/human-inbreeding-has-decreased-in-time-through-the-holocene-published-in-current-biology/) - Araştırmacılarımızın son makalesi akrabalar arası çiftleşmenin zamanla azaldığını ve bu eğilimin popülasyon boyutundaki tarıma bağlı büyümeyle ilişkili olabileceğini gösteriyor. Makalenin yazarları Francisco C. Ceballos, Kanat Gürün, Ezgi Altınışık, Hasan Can Gemici, Cansu Karamurat, Dilek Koptekin, Kıvılcım Başak Vural, Igor Mapelli, Ekin Sağlıcan, Elif Sürer, Yılmaz Selim Erdal, Anders Götherström, Füsun Özer, Çiğdem Atakuman ve Mehmet - [“Anadolu Neolitik koyununun arkeogenetik analizi, evcilleştirme sonrası karmaşık bir demografik tarihe işaret ediyor” Communications Biology’de](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/11/12/archaeogenetic-analysis-of-neolithic-sheep-from-anatolia-suggests-a-complex-demographic-history-since-domestication-published-in-communications-biology/) - Araştırmacılarımızın son makalesi, koyunların günümüzden on bin yıl önce Anadolu'nun yanı sıra başka bölgelerde de evcilleştirildiğini düşünürüyor. Makalenin yazarları Erinç Yurtman, Onur Özer, Eren Yüncü, Nihan Dilşad Dağtaş, Dilek Koptekin, Yasin Gökhan Çakan, Mustafa Özkan, Ali Akbaba, Damla Kaptan, Gözde Atağ, Kıvılcım Başak Vural, Can Yümni Gündem, Louise Martin, Gülşah Merve Kılınç, Ayshin Ghalichi, Sinan - ["Mitokondriyal dizilim, nesli tükenmiş Kıbrıs cüce su aygırının filogenetik sınıflandırmasını doğruladı" Zoological Journal of the Linnean Society'de](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/11/19/mitochondrial-sequences-of-the-extinct-cypriot-pygmy-hippopotamus-confirm-its-phylogenetic-placement-published-in-zoological-journal-of-the-linnean-society/) - Araştırmacılarımız, DNA korunumunu son derece güçleştiren iklim koşullarına rağmen, bu nesli tükenmiş Akdeniz türünün petröz kemiklerinden antik DNA analizi yürütmeyi başardı. Çalışmaları, Akdeniz su aygırlarının moleküler filogenisi açısından ilk adımı teşkil ediyor. Makalenin yazarları Nikolaos Psonis, Despoina Vassou, Loucas Nicolaou, Socrates Roussiakis, George Iliopoulos, Nikos Poulakakis ve Spyros Sfenthourakis. - [“The genetic identity of the earliest human-made hybrid animals, the kungas of Syro-Mesopotamia” published in Science Advances](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2022/01/15/the-genetic-identity-of-the-earliest-human-made-hybrid-animals-the-kungas-of-syro-mesopotamia-published-in-science-advances/) - Our researchers described the genetic identity of the oldest human-made hybrid animal called “kunga”, a 4,500-year-old equid which was bred for warfare in ancient Mesopotamia. The study concludes that kungas were hybrids between female domestic donkeys and male hemippes. The article is authored by E. Andrew Bennett, Jill Weber, Wejden Bendhafer, Sophie Champlot, Joris Peters, Glenn M. - ["Archaeogenetic analysis of Neolithic sheep from Anatolia suggests a complex demographic history since domestication" published in Communications Biology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/11/12/archaeogenetic-analysis-of-neolithic-sheep-from-anatolia-suggests-a-complex-demographic-history-since-domestication-published-in-communications-biology/) - The latest article by our researchers suggests that sheep were domesticated in different areas, along with the first sheep domesticated in Anatolia ten thousand years ago. The article is authored by Erinç Yurtman, Onur Özer, Eren Yüncü, Nihan Dilşad Dağtaş, Dilek Koptekin, Yasin Gökhan Çakan, Mustafa Özkan, Ali Akbaba, Damla Kaptan, Gözde Atağ, Kıvılcım Başak - ["Mitochondrial sequences of the extinct Cypriot pygmy hippopotamus confirm its phylogenetic placement" published in Zoological Journal of the Linnean Society](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/11/19/mitochondrial-sequences-of-the-extinct-cypriot-pygmy-hippopotamus-confirm-its-phylogenetic-placement-published-in-zoological-journal-of-the-linnean-society/) - Our researchers led a successful analysis of ancient DNA from petrous bones of this extinct Mediterranean species despite the region's notoriously adverse environmental conditions for DNA preservation. Their study constitutes the first step towards reconstruction of the molecular phylogeny of Mediterranean Hippopotaminae. The article is authored by Nikolaos Psonis, Despoina Vassou, Loucas Nicolaou, Socrates Roussiakis, - [NEOMATRIX kick-off meeting was held virtually](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/02/19/neomatrix-kick-off-meeting-was-held-virtually/) - The NEOMATRIX kick-off meeting was held virtually on the 17th and 18th of February, 2021, with approximately 60 participants. In her opening speech Eva-Maria Geigl explained how the project was conceived, where she made a homage to the late Dimitris Kafetzopoulos, FORTH’s PI for NEOMATRIX and one of the visionaries behind NEOMATRIX. Next, the PIs - [NEOMATRIX pandemi koşullarında yola çıktı](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/01/01/neomatrix-takes-off-amid-the-covid-19-pandemic-142-words/) - NEOMATRIX Ankara, Heraklion, Paris ve Stockholm'deki gruplarımızın bilimsel araştırma konusunda işbirliği yapmalarını ve deneyimlerini paylaşmalarını kapsayan üç yıllık bir projedir. Proje başvurusu COVID-19 salgınının patlak vermesinden çok önce tasarlanmış, Mayıs 2020'de resmen kabul edilmiştir. Orijinal plana göre, işbirliği etkinlikleri araştırmacıların bir ülkeden diğerine seyahat etmelerini ve ekip üyelerinin fiziksel olarak bir arada çalışmalarını öngörmekteydi. Ancak - [NEOMATRIX başlangıç toplantısı çevrimiçi olarak yapıldı](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/02/19/neomatrix-kick-off-meeting-was-held-virtually/) - NEOMATRIX başlangıç toplantısı 17 ve 18 Şubat 2021'de çevrimiçi olarak 60 civarı katılımcıyla gerçekleştirildi. Açılış konuşmasını yapan Eva-Maria Geigl, projenin nasıl ortaya çıktığını açıklarken, projenin tasarım aşamsında önemli rol oynayan ve FORTH adına projenin eşyürütücülüğünü üstlenen merhum Dimitris Kafetzopoulos'a saygı gösterisinde bulındu. Daha sonra, her bir paydaş kurumun baş araştırmacıları söz alarak kurumlarını tanıttılar ve - [İlk ortak lab toplantımızı yaptık](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/05/05/our-first-joint-lab-meeting-was-held-virtually/) - NEOMATRIX projesinin rutinine yer alan düzenli etkinliklerden çevrimiçi lab toplantıları, paydaşların kullandıkları protokollerle iş akışlarının standardize edilmesini ve araştırma sonuçlarının paylaşılmasını amaçlamaktadır. İlk ortak lab toplantımızı 5 Mayıs günü gerçekleştirdik. Yarım gün süren çevrimiçi etkinlikte, her birini soru-cevap ve tartışma oturumlarının takip ettiği dört konuşma yapıldı. Hacettepe Üniversitesi'nden Ezgi Altınışık "Çanak Çömlek Öncesi Neolitik Yukarı - [Studien "Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia" publicerades i Science Advances](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/01/06/human-population-dynamics-and-yersinia-pestis-in-ancient-northeast-asia-was-published-in-science-advances/) - Den första artikeln 2021 av våra forskare spårar en komplex demografisk historia i nordöstra Asien, tillsammans med ny forskning om den forntida förekomsten av pestrelaterad Y. pestis. Artikeln är författad av Gülşah Merve Kılınç, Natalija Kashuba, Dilek Koptekin, Nora Bergfeldt, Handan Melike Dönertaş, Ricardo Rodríguez-Varela, Dmitrij Shergin, Grigorij Ivanov, Dmitrii Kichigin, Kjunnej Pestereva, Denis Volkov, - [NEOMATRIX startmöte hölls virtuellt](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/02/19/neomatrix-kick-off-meeting-was-held-virtually/) - NEOMATRIX startmöte hölls virtuellt den 17 och 18 februari 2021 med cirka 60 deltagare. I sitt öppningstal förklarade Eva-Maria Geigl hur projektet utformats, där hon hyllade den avlidne Dimitris Kafetzopoulos, FORTHs PI för NEOMATRIX och en av visionärerna bakom NEOMATRIX. Därefter tog PI:erna för varje partner scenen för att introducera sina institutioner och deras forskare, - [Vårt första gemensamma labbmöte hölls virtuellt](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/05/05/our-first-joint-lab-meeting-was-held-virtually/) - Gemensamma laboratoriemöten online är regelbundna aktiviteter som ingår i rutinen för NEOMATRIX, avsedda för diskussioner om standardisering av protokoll och workflow mellan olika partners samt för att dela forskningsresultat. Vårt första gemensamma labbmöte den 5 majvar ett halvdags virtuellt evenemang bestående av fyra sessioner, vart och ett följt av en Q&A och diskussionssession. Ezgi Altınışık - ["Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia" published in Science Advances](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/01/06/human-population-dynamics-and-yersinia-pestis-in-ancient-northeast-asia-was-published-in-science-advances/) - The newest article by our researchers traces a complex demographic history in northeastern Asia, together with new research on the ancient occurence of plague-related Y. pestis. The article is authored by Gülşah Merve Kılınç, Natalija Kashuba, Dilek Koptekin, Nora Bergfeldt, Handan Melike Dönertaş, Ricardo Rodríguez-Varela, Dmitrij Shergin, Grigorij Ivanov, Dmitrii Kichigin, Kjunnej Pestereva, Denis Volkov, - [Our first joint lab meeting was held](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/05/05/our-first-joint-lab-meeting-was-held-virtually/) - Online joint lab meetings are regular activities included in the routine of NEOMATRIX, intended for standardizing protocols and pipelines across the partners as well as sharing research results. We held our first joint lab meeting on May 5th. It was a half-day virtual event comprising four talks, each followed with a Q&A and discussion session. - ["Human inbreeding has decreased in time through the Holocene" published in Current Biology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/07/02/human-inbreeding-has-decreased-in-time-through-the-holocene-published-in-current-biology/) - The latest article by our researchers shows that inbreeding decreased over time and that the decrease appears linked with population size increase enabled by agriculture. The article is authored by Francisco C. Ceballos, Kanat Gürün, Ezgi Altınışık, Hasan Can Gemici, Cansu Karamurat, Dilek Koptekin, Kıvılcım Başak Vural, Igor Mapelli, Ekin Sağlıcan, Elif Sürer, Yılmaz Selim - [“Million-year-old DNA sheds light on the genomic history of mammoths” published in Nature](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/02/17/million-year-old-dna-sheds-light-on-the-genomic-history-of-mammoths-was-published-in-nature/) - The second article in 2021 by our researchers shows that the Columbian mammoth that inhabited North America during the last ice age was a hybrid between the woolly mammoth and a previously unknown genetic lineage of the mammoth. The article is authored by Tom van der Valk, Patrícia Pecnerová, David Díez-del-Molino, Anders Bergström, Jonas Oppenheimer, - [“Variable kinship patterns in Neolithic Anatolia revealed by ancient genomes” published in Current Biology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/04/14/new-paper-variable-kinship-patterns-in-neolithic-anatolia-revealed-by-ancient-genomes/) - The newest article by our researchers questions genetic relatedness among co-burials in domestic buildings using 59 ancient genomes from Neolithic Anatolia. The results suggest non-biological kinship patterns in Neolithic Anatolia. The article is authored by Reyhan Yaka, Igor Mapelli, Damla Kaptan, Ayça Doğu, Maciej Chyleński, Ömür Dilek Erdal, Dilek Koptekin, Kıvılcım Başak Vural, Alex Bayliss, - [NEOMATRIX tar fart mitt under COVID-19-pandemin](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/01/01/neomatrix-takes-off-amid-the-covid-19-pandemic-142-words/) - NEOMATRIX är ett 3-årigt projekt som involverar ett forskningssamarbete och erfarenhetsutbyte mellan våra grupper i Ankara, Heraklion, Paris och Stockholm. Projektförslaget utformades långt före utbrottet av COVID-19-pandemin och godkändes officiellt i maj 2020. Enligt det ursprungliga förslaget skulle samarbetsgruppens aktiviteter innebära resor av forskare från olika städer och deltagarna antogs kunna arbeta tillsammans fysiskt. Planen - ["Million-year-old DNA sheds light on the genomic history of mammoths” publicerades i Nature](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/02/17/million-year-old-dna-sheds-light-on-the-genomic-history-of-mammoths-was-published-in-nature/) - Den andra artikeln 2021 av våra forskare visar att den colombianska mammut som fanns i Nordamerika under den senaste istiden var en hybrid mellan ullhårig mammut och en tidigare okänd mammut. Artikeln är författad av Tom van der Valk, Patrícia Pecnerová, David Díez-del-Molino, Anders Bergström, Jonas Oppenheimer, Stefanie Hartmann, Georgios Xenikoudakis, Jessica A. Thomas, Marianne - ["Variable kinship patterns in Neolithic Anatolia revealed by ancient genomes" publicerades i Current Biology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/2021/04/14/new-paper-variable-kinship-patterns-in-neolithic-anatolia-revealed-by-ancient-genomes/) - Den senaste artikeln av våra forskare ifrågasätter genetisk släktskapinom flerpersonersgravar påträffade i byggnadslämningar med 59 studerade genom från Anatolien under Neolitikum. Resultaten antyder icke-biologiska släktskapsmönster under Neolitikum i Anatolien. Artikeln är författad av Reyhan Yaka, Igor Mapelli, Damla Kaptan, Ayça Doğu, Maciej Chyleński, Ömür Dilek Erdal, Dilek Koptekin, Kıvılcım Başak Vural, Alex Bayliss, Camilla Mazzucato, ## Pages - [NEOMATRIX is an international scientific collaboration project that investigates the Neolithic expansion across the Mediterranean.](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/) - NEOMATRIX is based on promoting the idea of democratic networks across local labs, by forming an exemplary collaboration among labs from different countries addressing similar questions: METU / Hacettepe aDNA Lab (Turkey), FORTH-IMBB and FORTH-ICS (Greece), Stockholm University Centre for Palaeogenetics (Sweden), and Institut Jacques Monod, Université de Paris and French National Centre for Scientific Research (France). The project is funded by the European Commission’s H2020 grant programme. - [NEOMATRIX ist ein internationales wissenschaftliches Kooperationsprojekt, das die neolithische Expansion im Mittelmeerraum untersucht.](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/) - NEOMATRIX ist ein vom European Commission’s H2020 grant programme finanziertes vierjähriges internationales wissenschaftliches Netzwerk-Projekt des europäischen Twinning (Zwillings-) Instrumentes. Twinning zielt darauf ab, langfristige Beziehungen zwischen bestehenden und zukünftigen EU-Ländern zu fördern und konkrete, verpflichtende operationelle Ergebnisse durch kollegiale peer-to-peer Aktivitäten zu erzielen. NEOMATRIX wird dies durch die Ausbildung junger WIssenschaftler im Rahmen eines wissenschaftlichen - [NEOMATRIX est une collaboration scientifique internationale qui étudie l'expansion du Néolithique en Méditerranée.](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/) - NEOMATRIX est une collaboration scientifique de quatre ans subventionnée par le programme Horizon 2020 de la Commission européenne dans le cadre des instruments européens de jumelage (Programme Twinning). Ce programme vise à stimuler des relations de longue durée entre les administrations des pays de l'UE actuels et futurs afin d'obtenir des résultats opérationnels concrets au - [NEOMATRIX är ett tre år långt internationellt vetenskapligt samarbets- och nätverksprojekt som undersöker den Neolitiska expansionen över Medelhavsområdet.](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/) - NEOMATRIX är ett fyra år långt internationellt vetenskapligt samarbets- och nätverksprojekt som finansieras av Europeiska kommissionens H2020-bidragsprogram inom ramen för det europeiska twinning-programmet. Twinning syftar till att främja långsiktiga relationer mellan enheter i befintliga och framtida EU-länder och att uppnå konkreta aktiviteter genom peer-to-peer-aktiviteter. NEOMATRIX kommer att uppnå detta genom utbildning och träning av unga - [NEOMATRIX, Neolitik dönüşümün Akdeniz'deki yayılımını araştıran uluslararası bir bilimsel işbirliği projesidir.](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/) - NEOMATRIX, Avrupa Twinning aygıtı çerçevesinde Avrupa Komisyonu'nun H2020 hibe programı ile desteklenen dört yıl süreli bir uluslararası bilimsel işbirliği projesidir. Twinning, mevcut ve müstakbel AB ülkelerindeki yönetimler arasında uzun vadeli ilişkilerin geliştirilmesini ve denkler arasındaki aktiviteler aracılığıyla somut ve kesin operasyonel sonuçlar elde edilmesini amaçlar. NEOMATRIX bunu, projede yer alan dört paydaş laboratuvarın deneyimlerini bir - [IJM-CNRS (Frankrike)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/ijm-and-cnrs-france/) - The “Epigenomics and Paleogenomics” Gruppen "Epigenomics and Paleogenomics" från Institut Jacques Monod, Université de Paris och French National Center for Scientific Research (CNRS) är intresserad av utvecklingen av genom, arter och populationer av djur, inklusive människor. Deras tillvägagångssätt är studiet av DNA som bevarats i arkeologiska och paleontologiska ben eftersom dessa är de direkta vittnen - [IJM-CNRS (Fransa)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/ijm-and-cnrs-france/) - Fransa Ulusal Bilimsel Araştırma Merkezi (CNRS) ve Paris Üniversitesi tarafından ortaklaşa oluşturulan Jacques Monod Enstitüsü (IJM) bünyesindeki Epigenomik ve Paleogenomik Grubu, insan da dahil olmak üzere hayvan tür ve popülasyonları ile genomlarının evrimi üzerine çalışmaktadır. Araştırma yaklaşımı, arkeolojik ve paleontolojik kemiklerde muhafaza edilmiş DNA'nın incelenmesidir; zira bunlar evrimin doğrudan tanığıdır. Antik genomların analizindeki güvenirlik ve - [IJM-CNRS (France)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/ijm-and-cnrs-france/) - The “Epigenomics and Paleogenomics” group of the Institut Jacques Monod, Université de Paris and French National Centre for Scientific Research (CNRS) is interested in the evolution of genomes, species and populations of animals, including humans. Their approach is the study of DNA preserved in archaeological and paleontological bone since these are the direct witnesses of - [SU-CPG (İsveç)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/su-sweden/) - Stockholm Üniversitesi (SU) Paleogenetik Merkezi (CPG) 2020'de İsveç Doğa Tarihi Müzesi ve Stockholm Üniversitesi'nin işbirliğiyle kurulmuş, son teknolojilerle donatılmış bir antik DNA tesisidir. İki kurumun bünyesindeki tüm antik DNA aktivitelerini çatısı altında toplayan CPG, böylelikle antik fauna, paleoekoloji, antik mikroplar ve arkeogenetik konularında yeterliğe sahip olduğu gibi, örneklemeden down-stream veri analizine dek analitik zincirin tamamına - [SU-CPG (Sverige)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/su-sweden/) - Stockholms universitet (SU) är värd för Centre for Palaeogenetics (CPG), som är en helt ny enhet för aDNA-forskning som inrättades 2020 genom ett samarbete mellan Naturhistoriska riksmuseet och Stockholms universitet, som samlar alla aktiviteter knutna till aDNA-forskning inom de två organisationerna. Således finns det inom CPG kompetens om forntida fauna, paleoekologi, forntida mikrober, arkeogenetik, och - [SU-CPG (Sweden)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/su-sweden/) - Stockholm University (SU) hosts the Centre for Palaeogenetics (CPG), a brand new ancient DNA facility established in 2020 through a collaboration between the Swedish Natural History Museum and Stockholm University, which collects all ancient DNA activities within the two organisations. Thus, within CPG there is competence for ancient fauna, palaeoecology, ancient microbes, archaeogenetics, and also - [FORTH-IMBB och FORTH-ICS (Grekland)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/forth-imbb-and-forth-ics-greece/) - Foundation for Research and Technology - Hellas (FORTH) är ett av de mest framstående forskningscentren i Grekland och även internationellt. FORTH deltar i NEOMATRIX med två av sina åtta institut; IMBB och ICS. The Institute of Molecular Biology and Biotechnology (FORTH-IMBB) har lång erfarenhet av genomanalys och genomavkodning av flera modellorganismer. Med utgångspunkt från denna - [FORTH-IMBB and FORTH-ICS (Greece)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/forth-imbb-and-forth-ics-greece/) - The Foundation for Research and Technology - Hellas (FORTH) is one of the top research centres in Greece and internationally. FORTH participates in NEOMATRIX with two of its eight institutes: IMBB and ICS. The Institute of Molecular Biology and Biotechnology (FORTH-IMBB) has long experience in genomic analysis and participation in genome decoding of several model - [FORTH-IMBB ve FORTH-ICS (Yunanistan)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/forth-imbb-and-forth-ics-greece/) - Yunanistan Araştırma ve Teknoloji Kurumu (FORTH) ülke çapındaki ve küresel ölçekteki en önemli araştırma merkezlerinden biridir. FORTH, NEOMATRIX projesine toplam sekiz enstitüsünden ikisiyle katılmaktadır: IMBB ve ICS. Genom analizi konusunda uzun bir deneyime sahip olan Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Enstitüsü (FORTH-IMBB) birçok model organizmanın genomunun deşifre edilmesine katkıda bulunmuştur. FORTH-IMBB hem bu deneyimden, hem de - [METU/Hacettepe aDNA Lab (Turkiet)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/metu-and-hu-ancient-dna-labs-turkey/) - Turkiets första laboratorium för aDNA forskning grundades 2012 vid Middle East Technical University (METU) Department of Biology av İnci Togan, med stöd av Turkiets vetenskapliga och tekniska forskningsråd (TÜBITAK). Teamet publicerade den första DNA-analysen av forntida får från Anatolia samma år. Fascinerad av debatter kring släktskap vid Çatalhöyük, anslöt populationsgenetiker Mehmet Somel till teamet 2013. - [ODTÜ/Hacettepe aDNA Laboratuvarı (Türkiye)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/metu-and-hu-ancient-dna-labs-turkey/) - Türkiye'nin ilk antik DNA labortuvarı 2012 yılında Orta Doğu Teknik Üniversitesi (ODTÜ) Biyoloji Bölümü'nde İnci Togan tarafından, Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu'nun (TÜBİTAK) desteğiyle kuruldu. Ekip Anadolu'nun ilk antik koyun DNA analizini aynı yıl yayımladı. Çatalhöyük kazıları sırasındaki akrabalık tartışmaları üzerinden konuya ilgi duyan hesaplamalı biyolog Mehmet Somel 2013'te ekibe katıldı. Çatalhöyük'te çalışan antropologlar, - [METU/Hacettepe aDNA Lab (Turkey)](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/metu-and-hu-ancient-dna-labs-turkey/) - Turkey's first ancient DNA lab was established in 2012 in Middle East Technical University (METU) Department of Biology by İnci Togan, with the support of Scientific and Technological Research Council of Turkey (TÜBITAK). The team published the first ancient sheep DNA analysis of Anatolia the same year. Intrigued by debates around kinship in Çatalhöyük, computational - [Die wissenschaftliche Frage und Forschungsmethode](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/the-scientific-question/) - Wie und warum bewegen sich Bevölkerungsgruppen fort und wie interagieren Neuankömmlinge mit den lokalen Gemeinschaften? Wie spiegeln sich Bevölkerungsbewegungen in der materiellen Kultur wider?” “Gibt es eine Beziehung zwischen Geschwindigkeit und Eigenschaft des Wechsels der materiellen Kultur und der Bevölkerungsgrösse? Wie formen Bevölkerungsbeziehungen und Wechsel materieller Kultur Geschlechterrollen und allgemeine sozioökonomische Ungleichheit? NEOMATRIX ist ein - [La question scientifique et la méthodologie de recherche](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/the-scientific-question/) - Pourquoi et comment les êtres humains se déplacent et comment les nouveaux-venus interagissent avec les communautés autochtones? Comment les mouvements de population se traduisent dans la culture matérielle? Existe-t-il des relations entre la vitesse et la nature des changements de culture matérielle et la taille des populations? Comment les interactions entre populations et les échanges - [Vetenskapliga frågeställningar och metodologi](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/the-scientific-question/) - Hur och varför rörde människor på sig och hur interageradede med de lokala samhällena? Hur återspeglas befolkningsrörelser i den materiella kulturen? Finns det ett samband mellan tempot och karaktären för förändringar i den materiella kultur och befolkningsstorleken? "Hur formadegruppernas interaktion och materiell kultur könsroller och socioekonomisk jämlikhet i allmänhet? NEOMATRIX är ett samarbetsprojekt som syftar - [Bilimsel soru ve araştırma metodolojisi](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/the-scientific-question/) - Tarih boyunca insan toplulukları nasıl hareket etmiştir? Bir yere yeni gelenler oranın yerlileriyle nasıl etkileşime girer? Nüfus hareketliliği maddi kültüre nasıl yansır? Maddi kültürdeki değişimin hızı ve niteliğiyle popülasyon boyutu arasında bir ilişki var mıdır? Nüfus etkileşimleri ve maddi kültür alışverişi, toplumsal cinsiyet rollerini ve genel olarak sosyoekonomik eşitsizliği nasıl şekillendirir? NEOMATRIX, günümüzden yaklaşık 8 - [The scientific question and the research methodology](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/the-scientific-question/) - How and why do humans move and how do the newcomers interact with the local communities? How is population movement reflected in the material culture? Is there a relationship between the rate and nature of the material culture change and the population size? How do population interactions and material culture exchanges shape gender roles and - [السؤال العلمي ومنهج البحث](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/the-scientific-question/) - لماذا وكيف يتحرك البشر وكيف يتفاعل القادمون الجدد مع مجتمعات السكان الأصليين يف تترجم تحركات السكان إلى ثقافة مادية؟ هل هناك علاقات بين سرعة وطبيعة التغييرات في الثقافة المادية وحجم السكان؟ كيف تشكل التفاعلات بين السكان وتبادل الثقافة المادية أدوار الجنسين وعدم المساواة الاجتماعية والاقتصادية بشكل عام؟ الحمض النووي القديم هو عملية استخراج الحمض النووي - [نيوماتركس هو مشروع تعاون علمي دولي يبحث في توسع العصر الحجري الحديث عبر البحر الأبيض المتوسط.](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/) - يتمثل المشروع المسمى نيوماتركس في تعاون علمي دولي يمتد على ثلاث سنوات بتمويل من برنامج المنح الأفق ٢٠٢٠ .(Twinningالتابعللمفوظية الدولية الاوروبية في إطار التوأمة الأوروبية (مشروع (Horizon 2020) يهدف هذا البرنامج إلى تحفيز العلاقات طويلة الأمد بين ادارات دول الإتحاد الأوروبي الحالية والمستقبليةمن أجل تحقيق نتائج تشغيلية ملموسة من خلال الأنشطة بين الشركاء. سيحقق نيوماتريكس - [الأخبار والأحداث والمنشورات](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/whats-new/) - [Aktuelles, Veranstaltungen und Publikationen](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/whats-new/) - [Actualité, événements et publications](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/whats-new/) - [Haberler, etkinlikler ve yayınlar](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/whats-new/) - [Nyheter, evenemang och senaste publikationer](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/whats-new/) ## Timeline Stories - [We ARE HERE](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/cool_timeline/we-are-here/) - [NEOMATRIX will end](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/cool_timeline/neomatrix-will-end/) - [NEOMATRIX kicks-off](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/cool_timeline/neomatrix-kicks-off/) ## Categories - [Uncategorized](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/uncategorized/) - [Uncategorized](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/uncategorized/) - [Publications](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/publications/) - [Activities](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/activities/) - [Announcements](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/announcements/) - [Activities](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/activities/) - [Announcements](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/announcements/) - [Publications](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/publications/) - [Activities](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/activities/) - [Announcements](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/announcements/) - [Publications](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/category/publications/) ## Tags - [Çatalhöyük](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/catalhoyuk/) - [kinship](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/kinship/) - [mammooth](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/mammooth/) - [Yersinia pestis](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/yersinia-pestis/) - [plague](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/plague/) - [demography](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/demography/) - [COVID-19](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/covid-19/) - [COVID-19](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/covid-19/) - [COVID-19](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/covid-19/) - [Çatalhöyük](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/catalhoyuk/) - [Çatalhöyük](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/catalhoyuk/) - [Yersinia pestis](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/yersinia-pestis/) - [Yersinia pestis](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/yersinia-pestis/) - [cattle](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/cattle/) - [sheep](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/sheep/) - [Crete](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/crete/) - [Greece](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/greece/) - [FORTH](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/forth/) - [Nafplioti](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/nafplioti/) - [cattle](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/cattle/) - [Crete](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/crete/) - [FORTH](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/forth/) - [Greece](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/greece/) - [Nafplioti](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/nafplioti/) - [sheep](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/sheep/) - [isotope](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/isotope/) - [strontium](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/strontium/) - [PCA](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/pca/) - [domestication](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/domestication/) - [goat](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/goat/) - [ancient pathogen](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/ancient-pathogen/) - [tapeworm](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/tapeworm/) - [ancient pathogen](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/ancient-pathogen/) - [domestication](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/domestication/) - [goat](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/goat/) - [tapeworm](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/tapeworm/) - [Ankara](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/ankara/) - [undergraduates](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/undergraduates/) - [courses](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/courses/) - [excursion](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/excursion/) - [site](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/site/) - [Ankara](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/ankara/) - [courses](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/courses/) - [excursion](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/excursion/) - [site](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/site/) - [undergraduates](https://blog.metu.edu.tr/wwwnmtrx/tag/undergraduates/)